Covid-19 : Initiatives de recherche de PSL

Face à l'épidémie Covid-19, les équipes scientifiques de l'Université PSL, toutes disciplines confondues, ont mobilisé leurs savoirs, expertises et équipements. Protocoles médicaux, développements thérapeutiques, mise en place de tests, modélisations et analyses des données, enquêtes, thèses... plus de 50 initiatives et projets de recherche sont en cours au sein de l'université afin de contribuer à la lutte contre la pandémie et d'évaluer l'impact social de la crise sanitaire.

La pandémie Covid-19 s'annonce d'ores et déjà comme l'une des plus graves pandémies de l'histoire contemporaine. Outre le lourd bilan humain, les conséquences politiques, économiques et sociales de cette crise sont majeures et constituent autant de sujets de réflexions actuels et futurs. Des sciences du vivant aux sciences humaines et sociales en passant par les mathématiques, la physique, la mécanique... les laboratoires et équipes scientifiques de l'Université PSL sont mobilisés pour apporter des premiers éléments de réponses.

Tour d'horizon par discipline non exhaustif des initiatives et projets de recherche en cours au sein de l'Université :

Biologie

Établissements PSL	Laboratoires et équipes scientifiques	Projet	Description du projet
ENS - PSL	Aleksandra Walczak, Thierry Mora (Laboratoire de Physique de l'ENS - PSL)		Viral dynamics at the individual and population levels: impact for antiviral treatment optimization. En savoir plus.
ESPCI Paris - PSL	Equipe de Yannick Rondelez	Développement de tests virologiques simples	Développer une méthode simple, PoC, rapide de détection de l’ARN viral. Deux voies sont envisagées : une approche non enzymatique par décoration de l'ARN viral, une deuxième impliquant des stratégies isothermes enzymatiques. En savoir plus.
ESPCI Paris - PSL / ENS - PSL	Equipe Vincent Croquette et Equipe Hervé Le Hir (ENS)	COVIDMAG	Test de l'hélicase nsp13 du virus Covid-19. Si un des ses inhibiteurs est validé cela pourrait constituer une première étape vers un médicament anti covid-19. En savoir plus.
Institut Curie - Centre de recherche	Franck Perez, DR CNRS et directeur de l’Unité ‘’Biologie Cellulaire et Cancer’’ - UMR144 (Institut Curie / CNRS / Sorbonne Université)	Développer des tests de dépistage à base d'anticorps (Projet 1)	Projet de recherche à objectif diagnostique. En savoir plus.
Institut Curie - Centre de recherche	Antonin Morillon, directeur de l’Unité ARN non-codant, épigénétique et fluidité du génome.	DARK-COVID19 (Projet 2)	Projet de recherche à objectif diagnostique : Vers un diagnostic et pronostic sanguin robuste du SRAS-CoV-2. En savoir plus.
Institut Curie - Centre de recherche	Franck Perez, DR CNRS et directeur de l’Unité ‘’Biologie Cellulaire et Cancer’’ - UMR144 (Institut Curie / CNRS / Sorbonne Université) en lien avec Elaine Del Nery, responsable de la plateforme BioPhenics (Institut Curie)	Identifier des molécules actives pour bloqure l'infection cellulaire du COVID-19 (Projet 3)	Projet de recherche à objectif diagnostique. En savoir plus.
Institut Curie - Centre de recherche	Nicolas Manel, DR Inserm et chef d’équipe dans l’Unité ‘’Immunité et Cancer’’ U932 (Institut Curie / Inserm / Université de Paris).	Etablir une preuve-de-concept sur une nouvelle plateforme vaccinale contre le COVID-19 et les futures infections émergentes (Projet 4)	Projet de recherche à objectif vaccinal. En savoir plus.
Institut Curie - Centre de recherche	Ludger Johannes, DR Inserm et directeur de l’unité “Chimie et Biologie de la Cellule” U1143-UMR3666 (Institut Curie / INSERM / CNRS)	Développement d’un vecteur de vaccination mucosale contre le COVID-19 (Projet 5)	Projet de recherche à objectif vaccinal. En savoir plus.
Institut Curie - Centre de recherche	Marie-Paule Teulade-Fichou, DR CNRS et directrice de l’Unité ‘’Chimie et Modélisation pour la Biologie du Cancer’’ - UMR9187/U1196 (Institut Curie / CNRS / Inserm / Université Paris Saclay)	SUDCovidG4 -Interaction between SARSCoV2 SUD domains and cellular Guanine quadruplexes (G4): screening for antiviral G4-ligands (Projet 6)	Projet de recherche à objectif thérapeutique : Criblage de molécules anti-virales. En savoir plus.
Institut Curie - Centre de recherche	Franck Perez, DR CNRS et directeur de l’Unité ‘’Biologie Cellulaire et Cancer’’ - UMR144 (Institut Curie / CNRS / Sorbonne Université) en lien avec Raphaël Rodriguez, DR CNRS et chef d’équipe dans l’Unité ‘’Chimie et Biologie de la Cellule’’ - UMR3666/U1143 (Institut Curie / CNRS / Inserm)	Identification de molécules actives pour bloquer l’infection cellulaire du COVID-19 (Projet 7)	Projet de recherche à objectif thérapeutique. En savoir plus.
Institut Curie - Centre de recherche	Stephan Vagner, DR Inserm et directeur de l’Unité « Intégrité du génome, ARN et Cancer Intégrité du génome, ARN et Cancer » IC / CNRS UMR3348 (Institut Curie / Inserm / Université Paris Saclay)	Rôles anti-SARS-CoV-2 et anti-inflammatoires des flavaglines (Projet 8)	Projet de recherche à objectif thérapeutique. En savoir plus.
Institut Curie - Centre de recherche	Clotilde Théry, DR Inserm et chef d’équipe dans l’Unité ‘’Immunité et Cancer’’ U932 (Institut Curie / Inserm / Université de Paris)	Développement de leurres biologiques pour bloquer l’infection par le SRAS-CoV-2 (Projet 9)	Projet de recherche à objectif vaccinal. En savoir plus.
Institut Curie - Centre de recherche	Christophe Lamaze, DR INSERM et Raphaël Rodriguez, DRCNRS et chef d’équipe dans l’Unité ‘’Chimie et Biologie de la Cellule’’ - UMR3666/U1143 (Institut Curie / CNRS / Inserm)	Lutter contre le syndrome d’orage de cytokines chez les patients COVID-19 (Projet 10)	Projet de recherche à objectif vaccinal. En savoir plus.
Institut Curie - Centre de recherche	Nicolas Manel, DR Inserm et chef d’équipe dans l’Unité ‘’Immunité et Cancer’’ U932 (Institut Curie / Inserm / Université de Paris).	Pourquoi le COVID-19 affecte-t-il plus sévèrement les personnes âgées et quel est le lien avec le vieillissement du système immunitaire ? (Projet 11)	Projet de recherche fondamental. En savoir plus.
Institut Curie - Centre de recherche	Kristine Schauer, chargée de recherche CNRS dans l’équipe de Bruno Goud au sein de l’Unité ‘’Biologie Cellulaire et Cancer’’ - UMR144 (Institut Curie / CNRS / Sorbonne Université)	Etude des mécanismes de réplication de l'ARN viral (Projet 12)	Projet de recherche fondamentale. En savoir plus.
Institut Curie - Centre de recherche	Inna Kuperstein, coordinatrice de projets, équipe Bioinformatique et biologie des systèmes du cancer, U900, Institut Curie	COVID-19 Disease Map, une ressource de biologie systémique pour l'étude des interactions hôte-virus (Projet 13)	Projet de recherche fondamentale. En savoir plus.
Institut Curie - Centre de recherche	Bruno Goud, DR CNRS, Renata Basto, DR CNRS, Franck Perez, DR CNRS (chefs d’équipes au sein de l’Unité ‘’Biologie Cellulaire et Cancer’’ - UMR144 (Institut Curie / CNRS / Sorbonne Université)) et Claire Hivroz, DR Inserm et chef d’équipe dans l’Unité ‘’Immunité et Cancer’’ U932 (Institut Curie / Inserm / Université de Paris)	Analyser le rôle des organelles cellulaires dans la réplication et la production du SARS-CoV-2 (COVID-19) (Projet 14)	Projet de recherche fondamentale. En savoir plus.

Chimie

Établissements PSL	Laboratoires et équipes scientifiques	Projet	Description
ESPCI Paris - PSL	Equipe de Yannick Rondelez	Développement de tests virologiques simples	Développer une méthode simple, PoC, rapide de détection de l’ARN viral. Deux voies sont envisagées : une approche non enzymatique par décoration de l'ARN viral, une deuxième impliquant des stratégies isothermes enzymatiques.

Génomique

Établissements PSL	Laboratoires et équipes scientifiques	Projet	Description du projet
Collège de France - PSL	Pr Lluis Quintana-Murci (titulaire chaire Génomique humaine et évolution du Collège de France, et directeur de l'unité de génétique évolutive humaine à l’Institut Pasteur)	COVID Human Genetic Effort	The COVID Human Genetic Effort is an international consortium aiming to discover: (i) Monogenic inborn errors of immunity (IEI), rare or common, underlying severe forms of COVID-19 in previously healthy individuals (ii) Monogenic variations, rare or common, which make certain individuals resistant to the infection by the SARS-CoV2 itself, despite repeated exposure. En savoir plus.

Management

Établissements PSL	Laboratoires et équipes scientifiques	Projet	Description du projet
MINES ParisTech - PSL , Dauphine - PSL	Centre de Gestion Scientifique - i3 UMR CNRS 9217 - chaire de théorie et méthodes de la conception innovante	Bureaucratie professionnelle technicisée	Thèse : Des systèmes de santé plus résilients – développer les capacités de conception robuste et responsable dans une bureaucratie professionnelle technicisée
MINES ParisTech - PSL , Dauphine - PSL	Centre de Gestion Scientifique - i3 UMR CNRS 9217	La crise du Covid 19 à la lumière de quelques thèses en cours en sciences de gestion au Centre de Gestion Scientifique	Les doctorants volontaires proposent sous un format libre (billet, publication, video…) une relecture d'une facette de la crise actuelle à la lumière de leurs travaux de thèse.
MINES ParisTech - PSL , Dauphine - PSL	Centre de Gestion Scientifique - i3 UMR CNRS 9217	Chaînes logistique résilientes	Thèse : pilotage de la capacité et des stocks dans des réseaux logistiques interconnectés dans un contexte de crise
MINES ParisTech - PSL	Valérie Archambault, Sophie Boulard, Maud Graindorge, Jean-Clément Guisiano, Julien Haccoun, Frédéric Kletz, Nicolas Petit, Thibault Plays, Paolo Stringari, Louise Theodon, Éric Weiland	MVM - Mechanical Ventilator Milano	Une fraction des personnes atteintes du Covid-19 a besoin d’une assistance respiratoire, ce qui a créé une demande mondiale sans précédent d’appareils de ventilation mécanique. Pour y répondre, une collaboration internationale principalement composée de physiciens des particules (dont le Canadien Art McDonald, lauréat du prix Nobel de physique en 2015) de médecins hospitaliers et d’entreprises, a relevé le défi de concevoir, développer, construire et certifier un respirateur open source à pression contrôlée, le MVM - Mechanical Ventilator Milano (https://mvm.care). La simplicité de sa conception mécanique permet la production à grande échelle dans des délais courts et à un coût limité, en s’appuyant sur des composants facilement disponibles dans le monde entier. Le MVM est passé de la conception à la réalité en six semaines. Ce résultat a été rendu possible par une collaboration internationale de scientifiques et d'entreprises principalement en Italie, au Canada et aux États-Unis. En France, le laboratoire Astroparticule et cosmologie (CNRS/Université de Paris) a été moteur dès le début, aux côtés du laboratoire Subatech (CNRS/Université de Nantes/IMT Atlantique) et de MINES ParisTech.
MINES ParisTech - PSL	Pr Le Masson, Centre de Gestion Scientifique - i3 UMR CNRS 9217	Situation room créative - ratiponalité inventive collective dans la gestion de crise	Recherche-intervention sur la gestion de crise (solutions pour faire face à la pénurie de pousse-seringues électriques pour l'ouverture de lits de réa covid - mision APHP)

Mathématiques

Etablissement PSL	Laboratoires et équipes scientifiques	Projet	Description du projet
Collège de France - PSL	Amaury Lambert (Centre Interdisciplinaire de Recherche en Biologie du Collège de France)	Alcov 2 - une étude de grande ampleur pour l'étude de la transmission de SARS-Cov2 au sein des foyers français https://alcov2.math.cnrs.fr/index.php/876874?lang=fr	Cette enquête est à destination de tous les foyers français ayant possiblement expérimenté, même sans certitude, la présence du nouveau coronavirus pendant la période de confinement. Nous cherchons à estimer les paramètres des processus de transmission du virus au sein des lieux de confinement, qui sont autant de micro-épidémies obéissant à certaines règles que nous cherchons à identifier.
Dauphine - PSL	Tous les laboratoires de Dauphine-PSL. Coordination Gabriel Turinici (Ceremade)	GT Covid19	Groupe de travail sur les différents aspects de la crise (notamment modèles de propagation et impacts socio-économiques
ENS - PSL	Chenlin Gu (Département de Mathématiques et Applications de l'ENS - PSL, UMR 8553)	Mathematical recommendations to fight against COVID-19	The statistics show that the mortality of COVID-19 is 20 times higher than seasonal flu and close to that of Spanish flu, hence it is becoming an absolute priority for every country to take efficient measure to limit the transmission of COVID-19. In this short paper, we propose a mathematical framework to model the contagion of COVID-19 by choosing three key parameters: infection rate, confirmation rate and quarantine efficiency ratio. We use the experience from China to calibrate the parameters, and then study the consequence of different measures. Our research suggest that working in distance and "distanciation sociale" (social distancing in French) is an efficient way to limit the contagion as soon as possible and highlight the risk of having a low confirmation rate which happens frequently when hospital is saturated.
ENS - PSL	Bertrand Maury (Département de Mathématiques et Applications de l'ENS - PSL, UMR 8553)	modélisation mathématique en Sciences du Vivant	Ecoulements sanguins, système respiratoire, aérosols (mouvement et dépôt de particules dans les voies aériennes), mouvements individuels et collectifs de cellules, mouvements de foules, propagation d’opinion dans les réseaux sociaux. Expérience dans le développement de modèles (écriture effective d’équations pour encoder des mécanismes inférés par l’observation plus ou moins complète d’une réalité). Travail très récent, à but essentiellement pédagogique (rédaction d’un chapitre de poly dédié, à destination de normaliens en 1A), sur les modèles mathématiques utilisés en épidémiologie: modèles SIR, SEIR, et extensions possibles : prise en compte de l’espace avec ajouts de termes de diffusion, modèles structurés en durée d’infection (permettant de prendre en compte de façon fine le degré d'infectiosité en fonction de la progression de l'infection,et développement de modèles sur réseaux qui pourraient présenter une certaine originalité. A partir de ces modèles sur réseaux, obtention formelle d’un système de propagation basé sur un mécanisme de diffusion croisée : le coefficient de diffusion pour une espèce (les Infectés) dépend de l’autre espèce (les Sains). Autre approche : modèle stochastique particulaire (le système est representé par un graphe dont les sommets sont les individus). Travail en collaboration avec Sylvain Faure, IR CNRS au LMO, en particulier sur la confrontation des modèles de type SIR aux données accessibles au jour le jour, pour les principaux pays concernés. Estimation effective des paramètres du modèles SIR (beta, gamma, et donc R0) à partir de ces données .
ENS - PSL	David Holcman (Institut de Biologie de l'ENS - PSL . CNRS UMR8197 . Inserm U1024)	1- Modélisation de la propagation de l'épidemie de CODIV-19 et conséquences sur la surcharge en soins intenstif, en fonction de données actualisées en temps reel. 2-Mesure de l'état cérébral dans le coma	1-Modèle épidémiologique de la propagation de l'épidemie en tenant compte de l'utilisation d'un anti-viral efficace, de la dynamique des places disponibles en soin intensif, la stratification de la population et la durée d'ímmunisation liée à la premiere vague. 2-Mise en place d'une analyse et d'un logiciel basés sur l'EEG pour prédire la sévérité du coma des patients en soins intensifs.
ENS - PSL	Raphael Cerf (Département de Mathématiques et Applications de l'ENS - PSL, UMR 8553)	modèle de quasi-espèce d'Eigen	Travail théorique sur un modèle mathématique pouvant être utilisé pour décrire la variabilité génétique des virus (un peu tous les virus, pas spécifique au covid19). Ce modèle a notamment servi pour concevoir une nouvelle stratégie thérapeutique pour le HIV, qui a donné lieu à des essais cliniques. Il est particulièrement intéressant pour les virus qui ont un taux de mutation tres élevé. L’espoir est de pouvoir utiliser un jour les descriptions statistiques données par ce type de modèle sur des données de séquençage réelles.

Mécanique

Établissements PSL	Laboratoires et équipes scientifiques	Projet	Description
MINES ParisTech - PSL	Igor VUJIC (IHEIE - MINES Paristech - PSL)	Centralisation d'initiatives d'impression 3D	Centralisation d'acteurs, de ressources documentaires et matérielles

Médecine

Établissements PSL	Laboratoires et équipes scientifiques	Projet	Description du projet
ENS - PSL	Aleksandra Walczak, Thierry Mora (Laboratoire de Physique de l'ENS - PSL)		Viral dynamics at the individual and population levels: impact for antiviral treatment optimization. En savoir plus.
ENS - PSL	Erwan Sallard, normalien en master de virologie		Etude d'un type de molécule antivirale, les Interferon-1 (IFN-1) dans la recherche d'un traitement contre le Covid-19. En savoir plus.
EPHE - PSL	Bérengère Guillery-Girard, Mickael Laisney et Julien Chavant (INSERM-EPHE-UNICAEN U1077)		Les participants de la cohorte Remember 13.11 que suit le laboratoire (200 personnes) vont recevoir un appel téléphonique, et se voir administrer des entretiens structurés menés par des psychologues et des psychiatres, ainsi que des questionnaires en ligne, pour étudier les effets de la situation sanitaire et des mesures de confinement sur leur état psychologique. Cette étude ponctuelle fait l’objet d’un amendement express au protocole, préparé avec le Pôle de Recherche Clinique de l’Inserm, promoteur de l’étude, qui sera déposé au CPP Nord-Ouest à brève échéance. L'objet principal de cette étude est de comprendre les effets de deux traumatismes (attentats du 13 novembre 2015 et pandémie associée aux mesures de confinement) sur la santé psychique. Au sein du laboratoire, Bérengère Guillery-Girard, Mickael Laisney et Julien Chavant sont impliqués dans cette étude.
Institut Curie - Ensemble hospitalier	Dr Emanuela Romano, directrice médicale du Centre d'immunothérapie des cancers de l'Institut Curie	Ensemble hospitalier : Curie-Covlm – Infection COVID 19 des patients atteints par le cancer, quelle réponse immunitaire ? (Projet 1)	Projet de recherche médicale. En savoir plus.
Institut Curie - Ensemble hospitalier	Dr Olivier Lantz, chef de l’Equipe lymphocytes T CD4, lymphocytes innés et cancer, U932	Ensemble hospitalier : Curie-O-SA – Une bibliothèque de sérums pour évaluer la qualité de la réponse immunitaire contre le COVID-19 (Projet 2)	Projet de recherche médicale. En savoir plus.
Institut Curie - Ensemble hospitalier	Dr Delphine Hequet, Service de chirurgie oncologique gynécologique et sénologique	Ensemble hospitalier : VIsio viSIt versus ONsite vIsit for pATients in a pandEmic context : Visionate - Téléconsultation ou visite à l’hôpital, la qualité des soins est-elle la même chez les patientes atteintes de cancer ? (Projet 3)	Projet de recherche médicale. En savoir plus.
Institut Curie - Ensemble hospitalier	Pr Fabien Reyal, Pr à l'Université de Paris, chef de Service de chirurgie gynécologique sénologique et reconstructrice à l’Institut Curie et chef de l’unité Résidu tumoral et réponse au traitement au Centre de recherche	Ensemble hospitalier : NEOTICO – L’infection par le Covid-19 influe-t-elle sur certains traitements contre le cancer du sein ? (Projet 4)	Projet de recherche médicale. En savoir plus.
Institut Curie - Ensemble hospitalier	Unité transversale d’éducation thérapeutique patient à l’Institut Curie	Baro-Cov (Projet 5)	Projet de recherche médicale Soins non urgents et pandémie, le baromètre patient. En savoir plus.
Institut Curie - Ensemble hospitalier	Dr Delphine Hequet, Service de chirurgie oncologique gynécologique et sénologique	SCOPE (Projet 6)	Projet de recherche médicale Suivi des effets des modifications des prises en charges des patientes ayant un cancer du sein précoce dans le contexte de pandémie COVID-19. En savoir plus.
Institut Curie - Ensemble hospitalier	Dr Paul Cottu, Dr Laurence Bozec, Pr Xavier Paoletti	BDD-Covid (Projet 7)	Projet de recherche médicale Registre unique des patients COVID-19 suspectés ou confirmés à l’Institut Curie. En savoir plus.

Physique

Etablissement PSL	Laboratoires et équipes scientifiques	Projet	Description du projet
ESPCI Paris - PSL	Institut Langevin, Equipe Ros-Kiri Ing, Mathias Fink	Imagerie ultrasonore sans contact des vibrations sonores du thorax	Développement d’une caméra ultrasonore ultrarapide sans contact qui permet d’observer les vibrations sonores de la surface du thorax produites par les vocalises. C’est un imageur sans contact et sans radiation ionisante qui peut être une alternative au scanner pour le SRAS et qui se comporte comme le feraient plusieurs centaines de stéthoscopes virtuels.

Sciences cognitives

Etablissement PSL	Laboratoires et équipes scientifiques	Projet	Description
ENS - PSL	Coralie Chevallier (LNC2 )/ Hugo Mercier (IJN) (Département d'Etudes Cognitives de l'ENS - PSL)	Handwashing as a behavioral challenge in the fight against Covid-19	How to deal with an epidemic in the absence of vaccines and treatment, when the only lever that is left for policy makers is to act on citizens’ behavior? We aim to identify behavioral and cognitive obstacles hindering the adoption of one such behavior, i.e. handwashing. Based on these insights, we will design messages tapping the most promising psychological levers. We will then launch online testing experiments to test the efficacy of various messages on self-reported handwashing intentions and other outcomes of interest. This will put us in a position to launch a large-scale field experiment in 300 schools in the Académie de Versailles.

Sciences des données

Établissements PSL	Laboratoires et équipes scientifiques	Projet	Description du projet
MINES ParisTech - PSL, Dauphine - PSL, INRIA	Jamal ATIF (Lamsade Dauphine - PSL, UMR 7243) Akin KAZAKCI (IHEIE - MINES Paristech - PSL) Igor VUJIC (IHEIE - MINES Paristech - PSL)	Application post-confinement	Développement d'une app post-confinement avec modèles de circulation de personnes et minimisation des risques de contagion

Sciences humaines et sociales

Établissements PSL	Laboratoires et équipes scientifiques	Projet	Description du projet
ENS - PSL / CNRS		Observatoire bibliographique	L'ESR et le CNRS sont engagés actuellement dans la réflexion sur la diffusion la plus large possible des études, recherches, contributions relatives à la pandémie, du côté LSHS. La bibliothèque de l'ENS a ouvert depuis le 20 mars une bibliographie collaborative sur zotero, ayant vocation à recenser les publications en LSHS relatives à la pandémie actuelle pour la consulter : https://www.zotero.org/groups/2467117/documentation_relative_au_nouveau_coronavirus_sars-cov-2/library pour rejoindre le groupe qui l'élabore : https://www.zotero.org/groups/2467117/documentation_relative_au_nouveau_coronavirus_sars-cov-2 Zotero s'est engagé à ouvrir une capacité de stockage illimitée sur ses serveurs aux institutions engagées dans de telles démarches. En savoir plus.

COVID-19 : la recherche française mobilisée

Le ministère de l'enseignement supérieur et de la recherche offre un tour d'horizon de la recherche sur le Covid-19 ainsi que des actions de solidarité en faveur des soignants.